Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS37DQ86XT2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms