Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD3Q86VQ6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms