Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms