Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE3BQ7Z3V4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms