Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD4Q7Z3J3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms