Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG9AQ7Z3C6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms