Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms