Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZRN4Q6ZMN7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZRN4Q6ZMN7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms