Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms