Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms