Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
REEP3Q6NUK4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms