Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDF6Q6KF10 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms