Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225Q6GV28 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms