Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNS3Q68CZ2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms