Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM208BQ5VWN6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms