Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms