Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NHSL1Q5SYE7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHSL1Q5SYE7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms