Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSD17B12Q53GQ0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms