Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HFEQ30201 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HFEQ30201 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms