Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms