Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME3Q16798 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ME3Q16798 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME3Q16798 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms