Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNAPC1Q16533 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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