Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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RPE65Q16518 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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