Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CDSNQ15517 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CDSNQ15517 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CDSNQ15517 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDSNQ15517 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDSNQ15517 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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