Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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