Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 WBP2-211ENST00000589642 568 ntTSL 314.25□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 WBP2-209ENST00000589236 747 ntTSL 212.54□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 WBP2-202ENST00000416574 987 ntTSL 212.31□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 WBP2-206ENST00000587374 480 ntTSL 410.79□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 WBP2-218ENST00000593002 610 ntTSL 410.1□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 D2HGDH-211ENST00000467427 555 ntTSL 318.62■□□□□ 0.578e-7■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 STAT6-210ENST00000554202 248 ntTSL 22.67□□□□□ -1.988e-16■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 DEAF1-204ENST00000525904 797 ntTSL 312.29□□□□□ -0.443e-9■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 DEAF1-212ENST00000530813 668 ntTSL 512.29□□□□□ -0.443e-9■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.596e-7■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 515.1■□□□□ 0.016e-7■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 PCMTD1-202ENST00000519554 814 ntTSL 36.79□□□□□ -1.323e-13■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 ZC3H11A-206ENST00000453771 1892 ntTSL 511.28□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.153e-7■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.393e-7■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 ZC3H11A-213ENST00000638800 7078 ntTSL 55.34□□□□□ -1.553e-7■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.563e-7■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.783e-7■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 STYXL1-211ENST00000474328 606 ntTSL 517.34■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 STYXL1-210ENST00000460184 636 ntTSL 212.27□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 STYXL1-206ENST00000431581 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 STYXL1-205ENST00000430497 651 ntTSL 1 (best)11.09□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 STYXL1-207ENST00000438695 764 ntTSL 1 (best)11.09□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 STYXL1-202ENST00000340062 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 THOC5-204ENST00000397873 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 THOC5-201ENST00000358079 2427 ntTSL 59.96□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 THOC5-210ENST00000443089 786 ntTSL 29.78□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 THOC5-209ENST00000442555 3012 ntTSL 28.72□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 THOC5-214ENST00000484924 909 ntTSL 57.13□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 STYXL1-209ENST00000454618 663 ntTSL 1 (best)5.91□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 THOC5-217ENST00000492707 550 ntTSL 34.67□□□□□ -1.663e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.468e-7■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC5.78□□□□□ -1.485e-8■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 RALGPS2-209ENST00000495034 1970 ntTSL 216.7■□□□□ 0.269e-8■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 EIF4E-202ENST00000418385 574 ntTSL 414.88□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.089e-8■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 312.2□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.469e-8■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 GRAMD1A-206ENST00000598073 582 ntTSL 310.99□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 RALGPS2-201ENST00000324778 906 ntTSL 54.74□□□□□ -1.659e-8■■■■■ 26.9
PCBP2Q15366 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 FAM104A-203ENST00000579872 422 ntTSL 29.16□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-209ENST00000423659 2329 ntTSL 511.43□□□□□ -0.587e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-220ENST00000440945 2658 ntTSL 1 (best)8.66□□□□□ -1.027e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 RAB3GAP2-201ENST00000237724 821 ntTSL 314.28□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 RAB3GAP2-207ENST00000478976 575 ntTSL 410.02□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 RAB3GAP2-204ENST00000474178 539 ntTSL 49.26□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.084e-16■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 STAT6-215ENST00000555222 2185 ntTSL 213.8□□□□□ -0.24e-16■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 STAT6-205ENST00000543873 3119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.594e-16■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 STAT6-216ENST00000555318 465 ntTSL 36.52□□□□□ -1.374e-16■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 PLEC-209ENST00000526416 583 ntTSL 315.93■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 PLEC-212ENST00000527816 583 ntTSL 312.85□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.394e-8■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 EIF2AK3-202ENST00000415570 2902 ntTSL 1 (best)5.11□□□□□ -1.594e-8■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.654e-8■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 DLEU1-210ENST00000469095 1736 ntTSL 511.44□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 DLEU1-233ENST00000491482 431 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 DLEU1-217ENST00000474630 518 ntTSL 59.71□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 DLEU1-223ENST00000483169 1304 ntTSL 27.24□□□□□ -1.251e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 DLEU1-222ENST00000480262 566 ntTSL 1 (best)7.22□□□□□ -1.251e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 L1CAM-207ENST00000420165 569 ntTSL 420.27■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 L1CAM-211ENST00000460553 556 ntTSL 420.2■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 L1CAM-212ENST00000464967 593 ntTSL 212□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 RAD54L-204ENST00000463715 718 ntTSL 515.39■□□□□ 0.055e-9■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 RAD54L-212ENST00000493985 810 ntTSL 414.85□□□□□ -0.035e-9■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 RAD54L-202ENST00000442598 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.855e-9■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 RAD54L-205ENST00000469835 648 ntTSL 39.59□□□□□ -0.875e-9■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 RAD54L-201ENST00000371975 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -15e-9■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.261e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.155e-10■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 GDI1-214ENST00000491154 4069 ntTSL 29.39□□□□□ -0.915e-10■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.81e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.288e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.438e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 LIG1-207ENST00000594759 4102 ntTSL 1 (best)11.64□□□□□ -0.558e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 LIG1-220ENST00000601091 3957 ntTSL 510.04□□□□□ -0.88e-7■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 C11orf49-220ENST00000533124 559 ntTSL 412.04□□□□□ -0.481e-8■■■■■ 26.8
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 180.9 ms