Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD4Q14839 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD4Q14839 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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