Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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ITGB3BPQ13352 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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ITGB3BPQ13352 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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ITGB3BPQ13352 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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ITGB3BPQ13352 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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ITGB3BPQ13352 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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ITGB3BPQ13352 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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ITGB3BPQ13352 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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ITGB3BPQ13352 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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ITGB3BPQ13352 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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ITGB3BPQ13352 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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