Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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