Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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RAB40BQ12829 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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RAB40BQ12829 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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RAB40BQ12829 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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RAB40BQ12829 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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RAB40BQ12829 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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RAB40BQ12829 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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RAB40BQ12829 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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RAB40BQ12829 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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