Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TROQ12816 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TROQ12816 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TROQ12816 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TROQ12816 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TROQ12816 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TROQ12816 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TROQ12816 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TROQ12816 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TROQ12816 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TROQ12816 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TROQ12816 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TROQ12816 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TROQ12816 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TROQ12816 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TROQ12816 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TROQ12816 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TROQ12816 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TROQ12816 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TROQ12816 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TROQ12816 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TROQ12816 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TROQ12816 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TROQ12816 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TROQ12816 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TROQ12816 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TROQ12816 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TROQ12816 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TROQ12816 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TROQ12816 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TROQ12816 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TROQ12816 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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