Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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