Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAPQ12770 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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