Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HMGXB3Q12766 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
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