Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms