Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN5Q08AF3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms