Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms