Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms