Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN1Q05586 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms