Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms