Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms