Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APBA1Q02410 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms