Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms