Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms