Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms