Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATN1P54259 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATN1P54259 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATN1P54259 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATN1P54259 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATN1P54259 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms