Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOSBP53539 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOSBP53539 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOSBP53539 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOSBP53539 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms