Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms