Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLK1P49759 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLK1P49759 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLK1P49759 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLK1P49759 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLK1P49759 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLK1P49759 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLK1P49759 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLK1P49759 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLK1P49759 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLK1P49759 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLK1P49759 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLK1P49759 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLK1P49759 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLK1P49759 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLK1P49759 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLK1P49759 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLK1P49759 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLK1P49759 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLK1P49759 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CLK1P49759 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLK1P49759 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLK1P49759 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLK1P49759 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLK1P49759 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLK1P49759 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLK1P49759 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLK1P49759 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLK1P49759 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLK1P49759 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLK1P49759 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLK1P49759 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLK1P49759 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLK1P49759 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLK1P49759 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLK1P49759 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLK1P49759 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLK1P49759 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLK1P49759 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLK1P49759 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLK1P49759 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLK1P49759 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLK1P49759 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLK1P49759 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms