Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GNPDA1P46926 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms